Identificazione mediante Whole Transcriptome Sequencing (WTS) del trascritto EML4-NTRK3 in un caso di tumore maligno del rene

INTRODUZIONE: Riarrangiamenti genici di NTRK (trascritto ETV6-NTRK3) sono presenti in circa il 70% dei casi di Fibrosarcoma congenito infantile(CFS) e nella variante cellulare del nefroma mesoblastico congenito (CMN), entrambi usualmente ad esordio <1anno. Recentemente anche il trascritto EML4-NTRK3 è stato descritto in case report di queste patologie. MATERIALI E METODI: Esordio a 4 anni di voluminosa massa addominale (13x19x14 cm) occupante il rene destro. Il quadro istologico-immunoistochimico ha deposto per Sarcoma a cellule chiare del rene (CCSK), la revisione istologica eseguita presso altri 3 centri di eccellenza nella diagnosi dei tumori renali pediatrici ha deposto per CCSK in due casi e T.Wilms anaplastico nel terzo. Dopo la nefrectomia totale, il paziente è stato sottoposto a trattamento chemioterapico previsto per le forme di CCSK St.III (Protocollo TW2003AIEOP), mantenendo la remissione completa con FUP di 7 anni. Il nostro caso è stato testato, ed è risultato negativo, per entrambe le alterazioni genetiche patognomoniche del CCSK di recente individuazione: l’internal tandem duplication (ITD) del gene BCOR (oltre il 98%) e la traslocazione t(10;17)(q22;p13) YWHAE-FAM22 (circa 12%), pertanto abbiamo analizzato il tessuto tumorale mediante WTS che ha identificato il trascritto EML4-NTRK3, derivante dalla traslocazione t(2;15)(p21;q25.3). Il riarrangiamento è stato validato in RT-PCR e FISH. CONCLUSIONI: Le moderne tecniche di sequenziamento hanno concesso di rilevare il coinvolgimento di una traslocazione altrimenti non ipotizzabile, considerando età del paziente e quadro anatomopatologico, e valutare l’implicazione diagnostica di alterazioni di NTRK3 anche al di fuori di CMN e CFS, nonché l’utilizzo di NTRK quale target terapeutico.